制藥工程專業
制藥工程專業屬于藥學、化學、化工、生物技術等專業的新興交叉學科和朝陽産業，也是人才需求最熱門的方向之一。該專業培養學生具有相關學科的基本理論、基本知識及實驗實踐技能，掌握新藥研究與開發的方法與技術，強調制藥工藝和工程技術的結合，強化工程應用和創新能力的培養，具備進行藥品工業化生産、全程質量管理及各類藥品檢驗分析的基本能力。
培養目标：該專業培養具有從事醫藥、農藥、中藥、生物化工等醫藥及其他精細化學品的科研、開發、生産和管理的工程技術人才。
主要課程：基礎化學、生物化學、儀器分析(含波譜分析)、化工原理、生理藥理學、制藥工程制圖、電工技術基礎、藥物化學、制藥工程學、藥物合成反應、制藥工藝學、微生物學、藥物分析、藥劑學、制藥工程進展、專業外文及文獻檢索、藥事法規與醫藥商務等。
就業方向：可在醫藥、農藥、生化、食品、輕工、藥品檢驗、貿易等行業，從事藥品生産技術開發、新藥研發、藥品營銷、企業管理及藥品質量控制和質量管理等工作；也可出國或考研究生繼續深造。
實訓條件：制藥工程基礎實驗、認識實習、生産實習、課程設計、畢業論文或設計、計算機應用及上機。
校企合作：目前擁有全國20多家知名醫藥企業，在學生畢業實習階段實行導師與學生之間的雙向選擇及本科生導師負責制，使學生能非常直觀地接受專業知識和技能，培養實際工作能力。
優秀畢業生：本專業的優秀畢業生主要去向，報考東南大學、華東理工大學、中國藥科大學等國内知名高等院校繼續攻讀碩士研究生，去中外獨資或合資的制藥企業、藥物研制開發的研究單位及設計單位、藥品質檢單位、藥品流通單位及教學單位等。
化學工程與工藝專業
化學工程與工藝專業是為了适應新世紀化學工業的發展需求而設置的一個厚基礎、寬口徑、适應性強的專業。對國家可持續發展戰略的實施，特别是對材料、生物、能源、環境等新興領域的發展和開拓具有極其重要的支撐作用。該專業重視基礎理論和專業技術知識的教學，強化實驗技能，工程實踐，計算機和外語應用能力訓練，培養具備化學工程與化學工藝方面的基本理論、專業知識、滿足行業發展需求的高素質應用型本科人才。
培養目标：該專業培養具備化學工程與化學工藝方面的基本理論、專業知識，具有創新意識和較強實踐能力，能夠滿足行業發展需求的高素質應用型本科人才。
主要課程：無機及分析化學、有機化學、物理化學、儀器分析(含波譜分析)、化工原理、化工制圖、電工技術基礎、化工熱力學、化工設備基礎、反應及分離工程、化學工藝學、化工過程控制及儀表、化工過程模拟與優化、化工設計等。
就業方向：該專業學生可選擇出國或考研究生繼續深造，也可在化工、醫藥，材料、能源、輕工、環保等行業從事生産技術管理、産品開發、工程設計、化工過程控制、市場營銷、企業管理、科學研究等工作。
實訓條件：該專業實驗室配備“氣/液相色譜、紅外光譜、紫外光譜、原子吸收、分子熒光”等先進的分析檢測儀器。已建成20餘個化工校外實習實訓基地，開展認識、生産實習，提升學生綜合素質和工程實踐能力。成立“東大化院-成賢學院”聯合科技創新平台，由東大多位教授博導指導，青年教師-研究生-本科生共同參與。
校企合作：開展“産學研”合作，已與“南京化工園區、揚子石化、南京紫金精細化工廠”等知名化工企業簽訂協議，校企聯合辦學，探索“3+1和3.5+0.5”等校企聯合培養新模式；堅持畢設選題與開發任務無縫對接，通過“做中學，學中做”的交叉融合，努力提升就業層次。
優秀畢業生：5年中，共有182名同學考取了碩士研究生，其中不乏985、211高校，考研的錄取率為17.80%。業界影響逐年增強，衆多畢業生已成為我省化工企業“生産管理-技術開發”的業務骨幹，成為企業發展的動力和不可或缺的中堅力量。
藥事管理專業
藥事管理專業培養具有藥學、管理學、經濟學、法學等相關的知識和技能，能在各類醫藥工商企業、藥品監督管理及相關機構從事醫藥社會問題分析、評估和研究，藥事與企業管理、分析、策劃以及教學、科研等方面的工作，探索藥學事業科學發展規律的複合型高級人才。
培養目标：該專業培養知識面寬，藥學、管理學、法學等基礎理論功底紮實，“知識、能力、素質”三位一體的社會急需的複合型、應用型專門人才。
主要課程：藥學概論、藥劑學、藥物化學、藥理學、藥物分析學、臨床醫學概論、基礎醫學概論、管理學、西方經濟學、民法、經濟法、社會學概論、國内外藥事法規、藥品質量管理等。
就業方向：在藥品（包括醫療器械、制藥裝備、醫藥中間體、化妝品、食品等）監督管理、衛生行政管理、醫藥衛生監察、醫藥經濟調控等部門和藥品生産經營企業、醫藥科研院所、醫藥資源調查研究、醫藥市場行為和特征分析、策劃及經營的高級藥事管理工作。
實訓條件：藥事管理是應用學科，要求具有理論聯系實際的實訓教學，實訓教學采取模拟法庭教學，藥品質量管理的現場教學，專家講座與專題研讨，并應用現代科技的多媒體、網絡慕課教學。
校企合作：為了培養學生實際的工作能力，與全國10多家知名醫藥企業合作，在學生畢業實習階段實行導師與學生之間的雙向選擇及本科生導師負責制，突出藥事管理方法與醫藥行業實際相結合，培養應用型人才。
優秀畢業生：本專業的優秀畢業生主要去向，報考東南大學、中國藥科大學、浙江工業大學等國内知名高等院校繼續攻讀碩士研究生，在藥品監督管理、衛生行政管理、藥品價格管理、醫療保險、醫藥衛生監察、醫藥經濟調控等部門和藥品生産經營企業、醫藥科研院所、醫療衛生機構等單位從事衛生和藥政活動的監督管理、醫藥資源調查研究、醫藥市場行為和特征分析、策劃及經營等藥事管理工作。
護理學專業
護理學專業依托東南大學醫學院的護理學專業建設。該專業培養學生掌握護理學的基本理論、基本知識、基本技能，掌握護理急、慢性和重症病人的護理原則、操作技術、專科護理和監護技能，并能夠應用護理程序對服務對象實施整體護理，使學生具備社區健康服務、護理管理和護理教育的基本能力。
培養目标：該專業培養具備人文社會科學、臨床醫學、預防保健的基本知識及護理學的基本理論知識和技能，能在護理領域從事臨床護理、預防保健、護理管理、護理教學和護理科研的高級專門人才。
主要課程：系統解剖學、生物化學、生理學、醫學微生物與免疫學、組織胚胎學、病理學、病理生理學、藥理學、健康評估、醫學統計學、專業主幹課 護理學導論、基礎護理學、護理心理學、内科學、内科護理學、外科學、外科護理學、婦産科護理學、兒科護理學、護理心理學。
就業方向：可以在醫院、學校、社區、康複療養院等單位工作，也可以選擇考研、出國深造等。
實驗實訓條件：主要的臨床教學基地為江蘇省首批三級甲等綜合性醫院、優質護理服務重點聯系醫院、護士崗位管理試點醫院——東南大學附屬中大醫院。
功能材料專業
功能材料專業主要學習功能材料的制備、組成、組織結構與性能之間關系的基本規律，接受功能材料的結構與性能檢測分析、設計與開發的基本訓練，是在國家新興産業結構調整下應運而生的國家特設專業，是多學科領域的跨學科專業。
培養目标：
功能材料專業培養掌握材料學、物理、化學、能源等相關學科的基本理論以及功能材料與器件的工藝原理、制備技術、分析測試方法等專業知識，能夠在能源轉換、儲存材料、光電材料、納米材料、功能複合材料等領域從事相關功能材料的設計、制備、物性測定、工藝設計，并具有初步的材料研究與開發能力、工業化生産及工程應用能力的複合型高素質應用型本科技術人才。
主要課程：
材料科學基礎、無機及分析化學、有機化學、物理化學、高分子化學與物理、材料工程原理、材料工程基礎、功能材料學、功能材料制備與合成、功能材料工程設備與控制、材料現代研究方法、新能源材料、納米材料與制備、光電及信息材料、先進高分子材料制備工藝等；
就業方向：
學生畢業後能在功能材料相關生産企業、科研院所、管理部門等單位從事技術研發、設計制造、項目開發、實驗研究、運行管理、技術支持、質量控制等工作，也可選擇出國或考研究生繼續深造。
實訓條件：
該專業實驗室配備“紅外光譜、紫外光譜、原子吸收、分子熒光光度計、激光粒徑分析儀、電化學工作站、d33壓電測試儀、四探針電阻測試儀”等先進的分析檢測儀器。已與多家本地區知名功能材料企業聯合建立校外實習實訓基地，開展認識、生産實習，提升學生綜合素質和工程實踐能力。成立“東大化院-成賢學院”聯合科技創新平台，由東大多位教授博導指導學生創新創業。